Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nkx2-3P97334 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Nkx2-3P97334 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nkx2-3P97334 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nkx2-3P97334 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nkx2-3P97334 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nkx2-3P97334 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms