Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cbx1P83917 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cbx1P83917 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cbx1P83917 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cbx1P83917 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms