Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TMF1P82094 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TMF1P82094 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TMF1P82094 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TMF1P82094 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TMF1P82094 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TMF1P82094 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TMF1P82094 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TMF1P82094 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TMF1P82094 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TMF1P82094 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TMF1P82094 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TMF1P82094 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
TMF1P82094 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TMF1P82094 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TMF1P82094 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TMF1P82094 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TMF1P82094 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TMF1P82094 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TMF1P82094 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TMF1P82094 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TMF1P82094 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TMF1P82094 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TMF1P82094 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TMF1P82094 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TMF1P82094 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TMF1P82094 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TMF1P82094 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TMF1P82094 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TMF1P82094 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TMF1P82094 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TMF1P82094 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TMF1P82094 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TMF1P82094 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TMF1P82094 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TMF1P82094 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TMF1P82094 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TMF1P82094 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
TMF1P82094 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TMF1P82094 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TMF1P82094 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TMF1P82094 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TMF1P82094 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TMF1P82094 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TMF1P82094 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TMF1P82094 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
TMF1P82094 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TMF1P82094 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TMF1P82094 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TMF1P82094 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TMF1P82094 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TMF1P82094 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TMF1P82094 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TMF1P82094 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TMF1P82094 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TMF1P82094 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TMF1P82094 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TMF1P82094 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TMF1P82094 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TMF1P82094 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
TMF1P82094 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TMF1P82094 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TMF1P82094 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TMF1P82094 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TMF1P82094 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TMF1P82094 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TMF1P82094 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TMF1P82094 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TMF1P82094 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TMF1P82094 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
TMF1P82094 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TMF1P82094 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TMF1P82094 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TMF1P82094 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
TMF1P82094 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TMF1P82094 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TMF1P82094 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TMF1P82094 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TMF1P82094 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TMF1P82094 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TMF1P82094 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TMF1P82094 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TMF1P82094 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TMF1P82094 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TMF1P82094 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TMF1P82094 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TMF1P82094 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TMF1P82094 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TMF1P82094 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TMF1P82094 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TMF1P82094 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TMF1P82094 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TMF1P82094 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TMF1P82094 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TMF1P82094 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
TMF1P82094 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TMF1P82094 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TMF1P82094 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TMF1P82094 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TMF1P82094 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms