Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIM1P81133 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIM1P81133 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIM1P81133 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIM1P81133 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIM1P81133 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIM1P81133 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIM1P81133 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIM1P81133 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIM1P81133 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIM1P81133 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIM1P81133 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIM1P81133 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIM1P81133 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SIM1P81133 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIM1P81133 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIM1P81133 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIM1P81133 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIM1P81133 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIM1P81133 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIM1P81133 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIM1P81133 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIM1P81133 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIM1P81133 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIM1P81133 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIM1P81133 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SIM1P81133 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIM1P81133 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SIM1P81133 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIM1P81133 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIM1P81133 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIM1P81133 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIM1P81133 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIM1P81133 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIM1P81133 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SIM1P81133 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIM1P81133 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIM1P81133 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIM1P81133 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIM1P81133 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SIM1P81133 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIM1P81133 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIM1P81133 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIM1P81133 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIM1P81133 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIM1P81133 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIM1P81133 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIM1P81133 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIM1P81133 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIM1P81133 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIM1P81133 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIM1P81133 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIM1P81133 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIM1P81133 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIM1P81133 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIM1P81133 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIM1P81133 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIM1P81133 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIM1P81133 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIM1P81133 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIM1P81133 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIM1P81133 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIM1P81133 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIM1P81133 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIM1P81133 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIM1P81133 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIM1P81133 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIM1P81133 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIM1P81133 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIM1P81133 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIM1P81133 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIM1P81133 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIM1P81133 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIM1P81133 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIM1P81133 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIM1P81133 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIM1P81133 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIM1P81133 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIM1P81133 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIM1P81133 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIM1P81133 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SIM1P81133 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIM1P81133 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIM1P81133 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIM1P81133 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIM1P81133 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIM1P81133 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIM1P81133 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIM1P81133 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIM1P81133 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIM1P81133 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIM1P81133 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIM1P81133 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIM1P81133 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIM1P81133 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIM1P81133 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIM1P81133 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIM1P81133 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIM1P81133 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIM1P81133 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms