Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gabpb2P81069 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gabpb2P81069 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gabpb2P81069 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gabpb2P81069 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gabpb2P81069 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms