Protein–RNA interactions for Protein: P80315

Cct4, T-complex protein 1 subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct4P80315 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cct4P80315 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cct4P80315 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cct4P80315 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cct4P80315 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cct4P80315 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cct4P80315 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cct4P80315 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cct4P80315 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cct4P80315 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cct4P80315 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cct4P80315 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cct4P80315 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cct4P80315 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cct4P80315 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cct4P80315 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cct4P80315 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cct4P80315 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cct4P80315 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cct4P80315 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cct4P80315 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cct4P80315 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cct4P80315 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cct4P80315 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cct4P80315 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cct4P80315 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cct4P80315 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cct4P80315 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cct4P80315 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cct4P80315 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cct4P80315 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cct4P80315 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms