Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx1P80205 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Otx1P80205 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otx1P80205 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Otx1P80205 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Otx1P80205 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otx1P80205 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otx1P80205 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otx1P80205 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Otx1P80205 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otx1P80205 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otx1P80205 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Otx1P80205 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Otx1P80205 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Otx1P80205 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Otx1P80205 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Otx1P80205 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Otx1P80205 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Otx1P80205 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Otx1P80205 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Otx1P80205 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Otx1P80205 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Otx1P80205 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx1P80205 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx1P80205 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx1P80205 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx1P80205 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx1P80205 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx1P80205 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Otx1P80205 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Otx1P80205 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms