Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELF3P78545 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ELF3P78545 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELF3P78545 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELF3P78545 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELF3P78545 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELF3P78545 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ELF3P78545 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ELF3P78545 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELF3P78545 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ELF3P78545 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ELF3P78545 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ELF3P78545 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ELF3P78545 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ELF3P78545 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELF3P78545 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ELF3P78545 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ELF3P78545 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ELF3P78545 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELF3P78545 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELF3P78545 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ELF3P78545 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELF3P78545 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELF3P78545 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ELF3P78545 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ELF3P78545 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELF3P78545 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELF3P78545 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ELF3P78545 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF3P78545 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF3P78545 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF3P78545 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF3P78545 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF3P78545 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF3P78545 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF3P78545 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF3P78545 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF3P78545 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ELF3P78545 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELF3P78545 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELF3P78545 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ELF3P78545 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELF3P78545 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ELF3P78545 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELF3P78545 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELF3P78545 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ELF3P78545 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF3P78545 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF3P78545 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF3P78545 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF3P78545 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF3P78545 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ELF3P78545 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELF3P78545 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELF3P78545 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ELF3P78545 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELF3P78545 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELF3P78545 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ELF3P78545 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ELF3P78545 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELF3P78545 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELF3P78545 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ELF3P78545 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF3P78545 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF3P78545 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF3P78545 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF3P78545 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ELF3P78545 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ELF3P78545 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ELF3P78545 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ELF3P78545 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ELF3P78545 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ELF3P78545 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ELF3P78545 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ELF3P78545 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ELF3P78545 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ELF3P78545 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELF3P78545 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELF3P78545 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELF3P78545 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELF3P78545 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELF3P78545 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELF3P78545 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF3P78545 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF3P78545 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF3P78545 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF3P78545 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF3P78545 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELF3P78545 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELF3P78545 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELF3P78545 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELF3P78545 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELF3P78545 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELF3P78545 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELF3P78545 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELF3P78545 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELF3P78545 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELF3P78545 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELF3P78545 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELF3P78545 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms