Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
PIP4K2BP78356 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PIP4K2BP78356 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PIP4K2BP78356 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PIP4K2BP78356 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PIP4K2BP78356 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PIP4K2BP78356 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PIP4K2BP78356 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PIP4K2BP78356 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PIP4K2BP78356 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PIP4K2BP78356 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PIP4K2BP78356 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PIP4K2BP78356 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PIP4K2BP78356 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PIP4K2BP78356 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PIP4K2BP78356 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PIP4K2BP78356 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PIP4K2BP78356 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PIP4K2BP78356 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PIP4K2BP78356 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PIP4K2BP78356 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PIP4K2BP78356 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PIP4K2BP78356 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PIP4K2BP78356 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PIP4K2BP78356 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms