Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sparcl1P70663 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sparcl1P70663 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sparcl1P70663 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sparcl1P70663 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sparcl1P70663 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms