Protein–RNA interactions for Protein: P70424

Erbb2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb2P70424 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Erbb2P70424 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Erbb2P70424 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Erbb2P70424 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Erbb2P70424 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Erbb2P70424 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Erbb2P70424 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Erbb2P70424 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Erbb2P70424 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Erbb2P70424 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Erbb2P70424 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Erbb2P70424 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Erbb2P70424 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Erbb2P70424 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Erbb2P70424 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Erbb2P70424 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Erbb2P70424 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.4 ms