Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shox2P70390 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shox2P70390 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shox2P70390 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shox2P70390 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shox2P70390 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shox2P70390 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shox2P70390 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shox2P70390 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shox2P70390 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shox2P70390 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shox2P70390 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shox2P70390 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shox2P70390 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shox2P70390 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shox2P70390 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms