Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HBBP68871 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HBBP68871 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HBBP68871 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HBBP68871 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HBBP68871 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBBP68871 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBBP68871 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBBP68871 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBBP68871 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBBP68871 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HBBP68871 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBBP68871 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HBBP68871 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HBBP68871 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HBBP68871 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HBBP68871 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HBBP68871 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HBBP68871 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HBBP68871 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HBBP68871 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HBBP68871 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HBBP68871 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HBBP68871 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HBBP68871 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HBBP68871 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HBBP68871 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HBBP68871 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HBBP68871 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HBBP68871 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HBBP68871 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HBBP68871 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HBBP68871 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HBBP68871 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HBBP68871 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HBBP68871 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HBBP68871 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HBBP68871 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HBBP68871 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HBBP68871 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HBBP68871 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HBBP68871 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HBBP68871 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HBBP68871 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HBBP68871 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HBBP68871 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HBBP68871 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HBBP68871 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HBBP68871 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HBBP68871 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HBBP68871 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HBBP68871 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HBBP68871 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HBBP68871 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HBBP68871 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HBBP68871 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HBBP68871 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HBBP68871 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HBBP68871 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HBBP68871 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HBBP68871 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HBBP68871 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HBBP68871 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HBBP68871 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HBBP68871 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HBBP68871 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HBBP68871 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HBBP68871 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HBBP68871 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HBBP68871 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HBBP68871 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HBBP68871 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HBBP68871 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBBP68871 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBBP68871 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HBBP68871 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBBP68871 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBBP68871 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBBP68871 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBBP68871 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBBP68871 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBBP68871 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBBP68871 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HBBP68871 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HBBP68871 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HBBP68871 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBBP68871 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBBP68871 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBBP68871 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBBP68871 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBBP68871 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBBP68871 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBBP68871 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBBP68871 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBBP68871 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HBBP68871 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBBP68871 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBBP68871 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBBP68871 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBBP68871 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms