Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntn5P68500 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn5P68500 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn5P68500 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms