Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubb4bP68372 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubb4bP68372 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms