Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM4P67936 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM4P67936 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM4P67936 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM4P67936 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM4P67936 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM4P67936 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPM4P67936 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPM4P67936 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPM4P67936 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPM4P67936 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPM4P67936 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPM4P67936 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPM4P67936 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPM4P67936 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM4P67936 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM4P67936 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM4P67936 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM4P67936 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM4P67936 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM4P67936 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM4P67936 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM4P67936 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM4P67936 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM4P67936 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM4P67936 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM4P67936 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM4P67936 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPM4P67936 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPM4P67936 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPM4P67936 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPM4P67936 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPM4P67936 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPM4P67936 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPM4P67936 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPM4P67936 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPM4P67936 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TPM4P67936 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
TPM4P67936 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM4P67936 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM4P67936 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM4P67936 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM4P67936 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM4P67936 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM4P67936 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPM4P67936 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPM4P67936 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM4P67936 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPM4P67936 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM4P67936 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM4P67936 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM4P67936 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM4P67936 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM4P67936 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM4P67936 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPM4P67936 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPM4P67936 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPM4P67936 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPM4P67936 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM4P67936 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM4P67936 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM4P67936 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM4P67936 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPM4P67936 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM4P67936 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM4P67936 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM4P67936 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM4P67936 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM4P67936 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM4P67936 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM4P67936 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM4P67936 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM4P67936 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM4P67936 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM4P67936 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM4P67936 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM4P67936 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPM4P67936 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM4P67936 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM4P67936 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM4P67936 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM4P67936 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM4P67936 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM4P67936 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM4P67936 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM4P67936 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPM4P67936 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPM4P67936 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPM4P67936 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPM4P67936 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPM4P67936 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPM4P67936 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPM4P67936 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TPM4P67936 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM4P67936 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM4P67936 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM4P67936 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM4P67936 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM4P67936 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM4P67936 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms