Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk2bP67871 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Csnk2bP67871 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Csnk2bP67871 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk2bP67871 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk2bP67871 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Csnk2bP67871 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms