Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YBX1P67809 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YBX1P67809 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
YBX1P67809 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YBX1P67809 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YBX1P67809 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YBX1P67809 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YBX1P67809 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YBX1P67809 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YBX1P67809 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YBX1P67809 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX1P67809 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX1P67809 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX1P67809 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX1P67809 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YBX1P67809 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX1P67809 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX1P67809 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX1P67809 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX1P67809 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX1P67809 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX1P67809 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX1P67809 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
YBX1P67809 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX1P67809 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX1P67809 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX1P67809 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX1P67809 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX1P67809 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YBX1P67809 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX1P67809 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX1P67809 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX1P67809 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YBX1P67809 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YBX1P67809 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YBX1P67809 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YBX1P67809 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YBX1P67809 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YBX1P67809 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YBX1P67809 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YBX1P67809 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YBX1P67809 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YBX1P67809 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX1P67809 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YBX1P67809 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX1P67809 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX1P67809 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX1P67809 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX1P67809 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX1P67809 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YBX1P67809 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX1P67809 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX1P67809 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX1P67809 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX1P67809 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX1P67809 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX1P67809 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX1P67809 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YBX1P67809 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YBX1P67809 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YBX1P67809 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YBX1P67809 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YBX1P67809 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YBX1P67809 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YBX1P67809 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YBX1P67809 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX1P67809 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX1P67809 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX1P67809 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX1P67809 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX1P67809 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX1P67809 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX1P67809 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YBX1P67809 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
YBX1P67809 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YBX1P67809 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YBX1P67809 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YBX1P67809 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YBX1P67809 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
YBX1P67809 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX1P67809 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX1P67809 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX1P67809 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX1P67809 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YBX1P67809 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX1P67809 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX1P67809 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX1P67809 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX1P67809 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX1P67809 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YBX1P67809 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YBX1P67809 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YBX1P67809 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YBX1P67809 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YBX1P67809 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YBX1P67809 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YBX1P67809 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YBX1P67809 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YBX1P67809 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YBX1P67809 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms