Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNC1P63316 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNC1P63316 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms