Protein–RNA interactions for Protein: P63300

Selenow, Selenoprotein W, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenowP63300 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenowP63300 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SelenowP63300 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenowP63300 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenowP63300 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenowP63300 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenowP63300 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenowP63300 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenowP63300 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenowP63300 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms