Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnrpnP63163 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SnrpnP63163 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SnrpnP63163 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpnP63163 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms