Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRPNP63162 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNRPNP63162 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms