Protein–RNA interactions for Protein: P63054

Pcp4, Calmodulin regulator protein PCP4, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4P63054 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcp4P63054 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4P63054 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcp4P63054 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms