Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRA2BP62995 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRA2BP62995 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRA2BP62995 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRA2BP62995 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms