Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA52P62987 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA52P62987 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA52P62987 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA52P62987 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA52P62987 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA52P62987 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA52P62987 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA52P62987 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA52P62987 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA52P62987 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA52P62987 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA52P62987 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA52P62987 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA52P62987 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA52P62987 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA52P62987 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA52P62987 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA52P62987 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA52P62987 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA52P62987 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA52P62987 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA52P62987 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA52P62987 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA52P62987 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA52P62987 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA52P62987 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA52P62987 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA52P62987 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA52P62987 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA52P62987 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA52P62987 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA52P62987 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBA52P62987 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBA52P62987 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBA52P62987 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBA52P62987 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA52P62987 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBA52P62987 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA52P62987 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA52P62987 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA52P62987 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA52P62987 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBA52P62987 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBA52P62987 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA52P62987 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
UBA52P62987 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBA52P62987 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBA52P62987 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA52P62987 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA52P62987 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBA52P62987 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBA52P62987 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBA52P62987 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA52P62987 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA52P62987 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBA52P62987 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBA52P62987 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBA52P62987 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBA52P62987 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA52P62987 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBA52P62987 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBA52P62987 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBA52P62987 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA52P62987 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA52P62987 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA52P62987 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA52P62987 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBA52P62987 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA52P62987 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA52P62987 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA52P62987 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA52P62987 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBA52P62987 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA52P62987 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA52P62987 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA52P62987 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA52P62987 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA52P62987 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBA52P62987 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA52P62987 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA52P62987 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA52P62987 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA52P62987 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA52P62987 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA52P62987 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA52P62987 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBA52P62987 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA52P62987 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA52P62987 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA52P62987 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA52P62987 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA52P62987 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA52P62987 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA52P62987 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBA52P62987 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA52P62987 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA52P62987 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA52P62987 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBA52P62987 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms