Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbx1P62878 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbx1P62878 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbx1P62878 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbx1P62878 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbx1P62878 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbx1P62878 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbx1P62878 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbx1P62878 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbx1P62878 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbx1P62878 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbx1P62878 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbx1P62878 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbx1P62878 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms