Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBX1P62877 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBX1P62877 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBX1P62877 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBX1P62877 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBX1P62877 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBX1P62877 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBX1P62877 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBX1P62877 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBX1P62877 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBX1P62877 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBX1P62877 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBX1P62877 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBX1P62877 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBX1P62877 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBX1P62877 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBX1P62877 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBX1P62877 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBX1P62877 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBX1P62877 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBX1P62877 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBX1P62877 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBX1P62877 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBX1P62877 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBX1P62877 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBX1P62877 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBX1P62877 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBX1P62877 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBX1P62877 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBX1P62877 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBX1P62877 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RBX1P62877 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBX1P62877 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBX1P62877 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBX1P62877 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBX1P62877 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBX1P62877 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RBX1P62877 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBX1P62877 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RBX1P62877 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBX1P62877 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBX1P62877 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RBX1P62877 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBX1P62877 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBX1P62877 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RBX1P62877 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBX1P62877 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBX1P62877 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RBX1P62877 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBX1P62877 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBX1P62877 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBX1P62877 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBX1P62877 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBX1P62877 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBX1P62877 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBX1P62877 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBX1P62877 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBX1P62877 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBX1P62877 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBX1P62877 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBX1P62877 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBX1P62877 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBX1P62877 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBX1P62877 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBX1P62877 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBX1P62877 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBX1P62877 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RBX1P62877 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBX1P62877 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBX1P62877 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBX1P62877 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBX1P62877 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBX1P62877 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBX1P62877 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBX1P62877 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBX1P62877 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBX1P62877 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBX1P62877 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBX1P62877 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBX1P62877 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBX1P62877 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBX1P62877 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBX1P62877 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBX1P62877 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms