Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d2P62838 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d2P62838 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d2P62838 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d2P62838 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2d2P62838 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2d2P62838 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d2P62838 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d2P62838 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d2P62838 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms