Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL23P62829 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL23P62829 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL23P62829 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL23P62829 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL23P62829 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL23P62829 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL23P62829 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL23P62829 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL23P62829 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL23P62829 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL23P62829 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23P62829 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23P62829 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23P62829 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL23P62829 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL23P62829 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL23P62829 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL23P62829 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL23P62829 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23P62829 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23P62829 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL23P62829 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL23P62829 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL23P62829 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL23P62829 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL23P62829 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL23P62829 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL23P62829 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23P62829 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23P62829 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23P62829 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23P62829 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL23P62829 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23P62829 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23P62829 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23P62829 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23P62829 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23P62829 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23P62829 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23P62829 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23P62829 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23P62829 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL23P62829 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23P62829 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23P62829 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23P62829 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23P62829 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPL23P62829 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL23P62829 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23P62829 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23P62829 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23P62829 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23P62829 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23P62829 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23P62829 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23P62829 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23P62829 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL23P62829 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23P62829 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23P62829 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23P62829 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23P62829 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23P62829 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23P62829 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23P62829 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23P62829 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL23P62829 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23P62829 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23P62829 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23P62829 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23P62829 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23P62829 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23P62829 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23P62829 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23P62829 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23P62829 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23P62829 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23P62829 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23P62829 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23P62829 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23P62829 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23P62829 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23P62829 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23P62829 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23P62829 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23P62829 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23P62829 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23P62829 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL23P62829 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL23P62829 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL23P62829 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL23P62829 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL23P62829 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23P62829 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23P62829 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23P62829 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23P62829 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23P62829 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23P62829 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms