Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Snrpd2P62317 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd2P62317 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpd2P62317 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms