Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM3P62310 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM3P62310 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM3P62310 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM3P62310 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM3P62310 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM3P62310 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM3P62310 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM3P62310 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM3P62310 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM3P62310 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM3P62310 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM3P62310 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM3P62310 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM3P62310 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM3P62310 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM3P62310 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM3P62310 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM3P62310 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM3P62310 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM3P62310 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM3P62310 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM3P62310 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM3P62310 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM3P62310 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM3P62310 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM3P62310 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM3P62310 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM3P62310 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM3P62310 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM3P62310 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM3P62310 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM3P62310 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM3P62310 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM3P62310 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM3P62310 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM3P62310 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM3P62310 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM3P62310 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM3P62310 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM3P62310 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM3P62310 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM3P62310 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM3P62310 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM3P62310 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM3P62310 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM3P62310 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM3P62310 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM3P62310 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM3P62310 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM3P62310 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSM3P62310 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM3P62310 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM3P62310 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM3P62310 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM3P62310 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM3P62310 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM3P62310 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM3P62310 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM3P62310 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM3P62310 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM3P62310 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM3P62310 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM3P62310 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM3P62310 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM3P62310 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM3P62310 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM3P62310 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM3P62310 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM3P62310 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM3P62310 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM3P62310 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM3P62310 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM3P62310 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM3P62310 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM3P62310 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM3P62310 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM3P62310 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM3P62310 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM3P62310 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM3P62310 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM3P62310 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM3P62310 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM3P62310 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM3P62310 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM3P62310 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM3P62310 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM3P62310 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM3P62310 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM3P62310 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM3P62310 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM3P62310 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM3P62310 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM3P62310 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSM3P62310 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM3P62310 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM3P62310 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM3P62310 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM3P62310 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM3P62310 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms