Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SnrpfP62307 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SnrpfP62307 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnrpfP62307 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SnrpfP62307 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms