Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpeP62305 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpeP62305 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpeP62305 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpeP62305 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms