Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copz1P61924 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copz1P61924 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copz1P61924 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Copz1P61924 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Copz1P61924 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Copz1P61924 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Copz1P61924 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copz1P61924 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copz1P61924 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Copz1P61924 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Copz1P61924 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copz1P61924 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copz1P61924 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copz1P61924 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Copz1P61924 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copz1P61924 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copz1P61924 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Copz1P61924 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Copz1P61924 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Copz1P61924 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Copz1P61924 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copz1P61924 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Copz1P61924 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copz1P61924 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Copz1P61924 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Copz1P61924 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copz1P61924 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copz1P61924 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Copz1P61924 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copz1P61924 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copz1P61924 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copz1P61924 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copz1P61924 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copz1P61924 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copz1P61924 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms