Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SnnP61807 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnnP61807 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SnnP61807 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnnP61807 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SnnP61807 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnnP61807 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnnP61807 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnnP61807 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnnP61807 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnnP61807 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnnP61807 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnnP61807 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnnP61807 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnnP61807 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SnnP61807 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SnnP61807 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnnP61807 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnnP61807 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnnP61807 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnnP61807 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnnP61807 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnnP61807 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnnP61807 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnnP61807 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnnP61807 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnnP61807 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnnP61807 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnnP61807 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnnP61807 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnnP61807 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnnP61807 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnnP61807 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnnP61807 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnnP61807 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnnP61807 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnnP61807 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnnP61807 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnnP61807 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnnP61807 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnnP61807 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnnP61807 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnnP61807 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SnnP61807 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SnnP61807 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SnnP61807 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SnnP61807 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SnnP61807 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnnP61807 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnnP61807 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnnP61807 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnnP61807 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnnP61807 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnnP61807 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnnP61807 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnnP61807 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnnP61807 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnnP61807 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnnP61807 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnnP61807 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnnP61807 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnnP61807 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnnP61807 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SnnP61807 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SnnP61807 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SnnP61807 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnnP61807 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnnP61807 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnnP61807 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnnP61807 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnnP61807 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnnP61807 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnnP61807 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnnP61807 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnnP61807 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnnP61807 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnnP61807 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnnP61807 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnnP61807 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnnP61807 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SnnP61807 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SnnP61807 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SnnP61807 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SnnP61807 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnnP61807 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnnP61807 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnnP61807 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnnP61807 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnnP61807 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnnP61807 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnnP61807 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnnP61807 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnnP61807 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnnP61807 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnnP61807 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SnnP61807 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnnP61807 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnnP61807 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnnP61807 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnnP61807 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms