Protein–RNA interactions for Protein: P61353

RPL27, 60S ribosomal protein L27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27P61353 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL27P61353 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL27P61353 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL27P61353 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL27P61353 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL27P61353 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL27P61353 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL27P61353 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL27P61353 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL27P61353 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL27P61353 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL27P61353 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL27P61353 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL27P61353 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL27P61353 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL27P61353 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL27P61353 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL27P61353 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL27P61353 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL27P61353 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL27P61353 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL27P61353 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL27P61353 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL27P61353 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL27P61353 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL27P61353 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL27P61353 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL27P61353 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL27P61353 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL27P61353 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL27P61353 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL27P61353 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL27P61353 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL27P61353 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL27P61353 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL27P61353 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL27P61353 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL27P61353 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL27P61353 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL27P61353 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL27P61353 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL27P61353 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL27P61353 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL27P61353 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL27P61353 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL27P61353 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL27P61353 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL27P61353 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL27P61353 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL27P61353 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL27P61353 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL27P61353 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL27P61353 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL27P61353 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL27P61353 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL27P61353 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL27P61353 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL27P61353 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL27P61353 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL27P61353 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL27P61353 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL27P61353 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL27P61353 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL27P61353 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL27P61353 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL27P61353 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL27P61353 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL27P61353 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL27P61353 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL27P61353 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL27P61353 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL27P61353 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL27P61353 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL27P61353 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL27P61353 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL27P61353 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL27P61353 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL27P61353 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL27P61353 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL27P61353 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL27P61353 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL27P61353 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL27P61353 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL27P61353 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL27P61353 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL27P61353 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL27P61353 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL27P61353 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL27P61353 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL27P61353 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL27P61353 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL27P61353 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL27P61353 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL27P61353 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL27P61353 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL27P61353 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL27P61353 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL27P61353 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL27P61353 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL27P61353 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms