Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME3P61289 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME3P61289 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME3P61289 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSME3P61289 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME3P61289 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME3P61289 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSME3P61289 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME3P61289 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME3P61289 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME3P61289 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME3P61289 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME3P61289 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME3P61289 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSME3P61289 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME3P61289 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME3P61289 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME3P61289 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME3P61289 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSME3P61289 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME3P61289 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME3P61289 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSME3P61289 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME3P61289 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME3P61289 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSME3P61289 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME3P61289 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSME3P61289 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME3P61289 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME3P61289 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME3P61289 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSME3P61289 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME3P61289 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME3P61289 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME3P61289 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSME3P61289 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME3P61289 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME3P61289 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSME3P61289 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME3P61289 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME3P61289 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME3P61289 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME3P61289 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSME3P61289 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME3P61289 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME3P61289 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSME3P61289 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME3P61289 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME3P61289 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME3P61289 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME3P61289 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME3P61289 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME3P61289 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSME3P61289 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME3P61289 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME3P61289 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME3P61289 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME3P61289 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME3P61289 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME3P61289 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME3P61289 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSME3P61289 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME3P61289 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME3P61289 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSME3P61289 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME3P61289 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME3P61289 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME3P61289 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME3P61289 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME3P61289 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PSME3P61289 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSME3P61289 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSME3P61289 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME3P61289 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME3P61289 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME3P61289 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME3P61289 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME3P61289 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME3P61289 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME3P61289 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME3P61289 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME3P61289 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME3P61289 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME3P61289 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME3P61289 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME3P61289 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME3P61289 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME3P61289 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME3P61289 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME3P61289 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME3P61289 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME3P61289 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME3P61289 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME3P61289 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME3P61289 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME3P61289 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME3P61289 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSME3P61289 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSME3P61289 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSME3P61289 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms