Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2NP61088 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBE2NP61088 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2NP61088 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms