Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PlnP61014 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PlnP61014 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PlnP61014 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PlnP61014 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PlnP61014 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PlnP61014 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PlnP61014 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PlnP61014 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PlnP61014 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PlnP61014 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PlnP61014 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PlnP61014 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PlnP61014 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PlnP61014 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PlnP61014 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PlnP61014 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PlnP61014 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PlnP61014 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PlnP61014 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PlnP61014 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PlnP61014 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PlnP61014 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PlnP61014 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PlnP61014 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PlnP61014 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PlnP61014 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PlnP61014 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PlnP61014 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PlnP61014 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PlnP61014 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PlnP61014 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PlnP61014 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PlnP61014 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PlnP61014 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PlnP61014 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PlnP61014 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PlnP61014 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PlnP61014 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PlnP61014 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PlnP61014 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PlnP61014 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PlnP61014 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PlnP61014 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PlnP61014 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PlnP61014 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PlnP61014 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PlnP61014 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PlnP61014 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PlnP61014 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PlnP61014 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PlnP61014 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PlnP61014 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PlnP61014 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PlnP61014 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PlnP61014 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PlnP61014 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PlnP61014 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PlnP61014 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PlnP61014 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PlnP61014 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PlnP61014 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PlnP61014 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PlnP61014 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PlnP61014 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PlnP61014 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PlnP61014 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PlnP61014 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PlnP61014 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PlnP61014 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PlnP61014 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PlnP61014 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PlnP61014 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PlnP61014 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PlnP61014 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PlnP61014 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PlnP61014 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PlnP61014 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PlnP61014 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PlnP61014 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PlnP61014 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PlnP61014 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PlnP61014 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PlnP61014 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PlnP61014 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PlnP61014 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PlnP61014 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PlnP61014 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PlnP61014 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PlnP61014 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PlnP61014 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PlnP61014 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PlnP61014 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PlnP61014 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PlnP61014 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PlnP61014 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PlnP61014 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PlnP61014 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PlnP61014 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PlnP61014 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms