Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sem1P60897 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sem1P60897 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sem1P60897 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sem1P60897 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sem1P60897 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sem1P60897 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sem1P60897 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sem1P60897 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sem1P60897 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sem1P60897 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sem1P60897 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sem1P60897 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sem1P60897 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sem1P60897 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sem1P60897 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms