Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRTAP10-9P60411 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP10-9P60411 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRTAP10-9P60411 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms