Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Wdhd1P59328 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Wdhd1P59328 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Wdhd1P59328 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Wdhd1P59328 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Wdhd1P59328 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Wdhd1P59328 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Wdhd1P59328 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Wdhd1P59328 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Wdhd1P59328 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Wdhd1P59328 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Wdhd1P59328 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Wdhd1P59328 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Wdhd1P59328 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Wdhd1P59328 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Wdhd1P59328 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Wdhd1P59328 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Wdhd1P59328 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Wdhd1P59328 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Wdhd1P59328 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Wdhd1P59328 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Wdhd1P59328 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Wdhd1P59328 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Wdhd1P59328 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Wdhd1P59328 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Wdhd1P59328 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Wdhd1P59328 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Wdhd1P59328 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdhd1P59328 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdhd1P59328 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdhd1P59328 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Wdhd1P59328 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Wdhd1P59328 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Wdhd1P59328 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Wdhd1P59328 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Wdhd1P59328 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms