Protein–RNA interactions for Protein: P59279

Rab2b, Ras-related protein Rab-2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2bP59279 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab2bP59279 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab2bP59279 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab2bP59279 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab2bP59279 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms