Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00310P59036 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00310P59036 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00310P59036 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00310P59036 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms