Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YBEYP58557 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YBEYP58557 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
YBEYP58557 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YBEYP58557 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YBEYP58557 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YBEYP58557 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
YBEYP58557 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YBEYP58557 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YBEYP58557 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YBEYP58557 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
YBEYP58557 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
YBEYP58557 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YBEYP58557 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YBEYP58557 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
YBEYP58557 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YBEYP58557 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YBEYP58557 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
YBEYP58557 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YBEYP58557 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YBEYP58557 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YBEYP58557 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBEYP58557 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBEYP58557 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
YBEYP58557 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBEYP58557 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBEYP58557 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBEYP58557 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBEYP58557 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
YBEYP58557 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBEYP58557 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBEYP58557 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBEYP58557 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YBEYP58557 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBEYP58557 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBEYP58557 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBEYP58557 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBEYP58557 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YBEYP58557 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
YBEYP58557 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YBEYP58557 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YBEYP58557 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
YBEYP58557 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBEYP58557 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YBEYP58557 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBEYP58557 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBEYP58557 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
YBEYP58557 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YBEYP58557 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
YBEYP58557 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YBEYP58557 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YBEYP58557 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YBEYP58557 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YBEYP58557 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
YBEYP58557 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YBEYP58557 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YBEYP58557 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YBEYP58557 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
YBEYP58557 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YBEYP58557 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBEYP58557 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBEYP58557 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBEYP58557 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBEYP58557 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YBEYP58557 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBEYP58557 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBEYP58557 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBEYP58557 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBEYP58557 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBEYP58557 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBEYP58557 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBEYP58557 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBEYP58557 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBEYP58557 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YBEYP58557 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
YBEYP58557 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YBEYP58557 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YBEYP58557 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
YBEYP58557 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
YBEYP58557 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
YBEYP58557 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
YBEYP58557 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
YBEYP58557 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBEYP58557 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBEYP58557 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBEYP58557 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBEYP58557 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YBEYP58557 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YBEYP58557 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YBEYP58557 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YBEYP58557 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YBEYP58557 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YBEYP58557 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBEYP58557 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBEYP58557 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBEYP58557 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBEYP58557 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBEYP58557 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YBEYP58557 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YBEYP58557 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms