Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FAM3BP58499 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM3BP58499 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3BP58499 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3BP58499 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3BP58499 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms