Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB25P57735 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB25P57735 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB25P57735 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB25P57735 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB25P57735 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB25P57735 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB25P57735 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB25P57735 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB25P57735 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB25P57735 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB25P57735 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB25P57735 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB25P57735 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB25P57735 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB25P57735 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB25P57735 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB25P57735 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB25P57735 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB25P57735 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB25P57735 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB25P57735 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB25P57735 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB25P57735 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB25P57735 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB25P57735 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB25P57735 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB25P57735 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB25P57735 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB25P57735 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB25P57735 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB25P57735 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB25P57735 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB25P57735 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB25P57735 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB25P57735 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB25P57735 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB25P57735 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB25P57735 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB25P57735 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB25P57735 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB25P57735 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB25P57735 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB25P57735 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB25P57735 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB25P57735 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB25P57735 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB25P57735 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB25P57735 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB25P57735 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB25P57735 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB25P57735 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB25P57735 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB25P57735 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB25P57735 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB25P57735 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB25P57735 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB25P57735 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB25P57735 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB25P57735 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB25P57735 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB25P57735 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB25P57735 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB25P57735 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB25P57735 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB25P57735 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB25P57735 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB25P57735 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB25P57735 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB25P57735 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB25P57735 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB25P57735 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB25P57735 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB25P57735 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB25P57735 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB25P57735 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB25P57735 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB25P57735 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB25P57735 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB25P57735 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB25P57735 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB25P57735 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB25P57735 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB25P57735 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB25P57735 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB25P57735 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB25P57735 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB25P57735 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB25P57735 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB25P57735 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB25P57735 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB25P57735 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB25P57735 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB25P57735 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB25P57735 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB25P57735 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB25P57735 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB25P57735 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB25P57735 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB25P57735 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms