Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCBP3P57721 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCBP3P57721 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCBP3P57721 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCBP3P57721 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCBP3P57721 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms