Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp5bP56480 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp5bP56480 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp5bP56480 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp5bP56480 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp5bP56480 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms