Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp5P56399 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp5P56399 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp5P56399 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp5P56399 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp5P56399 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp5P56399 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp5P56399 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp5P56399 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp5P56399 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp5P56399 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp5P56399 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp5P56399 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp5P56399 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp5P56399 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp5P56399 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp5P56399 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp5P56399 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp5P56399 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp5P56399 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp5P56399 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp5P56399 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp5P56399 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp5P56399 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp5P56399 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms